提出扶持农业农村发展的财政政策和项目建议，组织提出农业投资规模、方向的建议并监督实施；编报部门预算并组织执行；参与农村金融、农业保险的政策咨询；指导监督局属单位财务、资产和政府采购管理工作；组织开展农业财政及基本建设项目专项审计辅助工作；组织开展所属单位负责人经济责任审计和其他专项内部审计辅助工作；制定预算绩效管理相关制度，组织开展预算绩效管理及预算项目绩效评价工作；负责农业三项补贴。