农村危房改造认定程序是先确认身份信息，后鉴定危房等级。住房城乡建设部门是依据乡村振兴、民政部门提供的农村低收入群体等6六类重点对象名单，再组织开展住房安全性鉴定（评定），对经鉴定（评定）住房确属C级、D级的农户或无房户列为年度农村危房改造对象。

对于已实施过农村危房改造但由于小型自然灾害等原因又变成危房且农户符合条件的，有条件的地区可将其再次纳入支持范围，但已纳入村民住房灾后恢复重建或农房抗震改造补助范围的，不得重复享受农村危房改造补助。